Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms