Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm9955Q8CEJ8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm9955Q8CEJ8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms