Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh13Q8CEE7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms