Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx30Q8CE50 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx30Q8CE50 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms