Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc17Q8CE13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms