Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc63Q8CDV6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms