Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms