Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms