Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Podxl2Q8CAE9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Podxl2Q8CAE9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms