Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A430089I19RikQ8C9W1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms