Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara3Q8C850 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scara3Q8C850 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms