Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclre1bQ8C7W7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dclre1bQ8C7W7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms