Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ssxb2Q8C5Z3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb2Q8C5Z3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms