Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms