Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4aQ8BW72 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms