Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcl3Q8BVF2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms