Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp398Q8BV16 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms