Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms