Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms