Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms