Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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