Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Htatsf1Q8BGC0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Htatsf1Q8BGC0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms