Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms