Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfascQ810U3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms