Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms