Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Amigo1Q80ZD8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Amigo1Q80ZD8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms