Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crb2Q80YA8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms