Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms