Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srrm3Q80WV7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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