Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rims3Q80U57 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms