Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdp1Q7TSG2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms