Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1bQ7TSF1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms