Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms