Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek5Q7TSC3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms