Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actn1Q7TPR4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms