Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tigd3Q7TM95 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tigd3Q7TM95 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms