Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc6aQ78XR0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc6aQ78XR0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms