Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sys1Q78S06 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sys1Q78S06 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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