Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim12Q78RX3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms