Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms