Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms