Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja6Q6S5G4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms