Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc154Q6RUT8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms