Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg2aQ6P4T0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg2aQ6P4T0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms