Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl3Q6P1Y1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl3Q6P1Y1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms