Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms