Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rprd2Q6NXI6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd2Q6NXI6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms