Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mvb12bQ6KAU4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mvb12bQ6KAU4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mvb12bQ6KAU4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms