Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms