Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q6DFW0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q6DFW0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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